MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187098	GCA	2	6	210	215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249776
2	NT_187098	GCGT	2	8	306	313	0 %	25 %	50 %	25 %	409249776
3	NT_187098	TGA	2	6	396	401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249776
4	NT_187098	CTT	2	6	456	461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249776
5	NT_187098	T	6	6	516	521	0 %	100 %	0 %	0 %	409249776
6	NT_187098	CG	3	6	537	542	0 %	0 %	50 %	50 %	409249776
7	NT_187098	ATC	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249776
8	NT_187098	CAT	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249776
9	NT_187098	TGA	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249776
10	NT_187098	ACCA	2	8	754	761	50 %	0 %	0 %	50 %	409249776
11	NT_187098	GGC	2	6	918	923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249776
12	NT_187098	CGC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249776
13	NT_187098	CAGCG	2	10	985	994	20 %	0 %	40 %	40 %	409249776
14	NT_187098	CAG	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249776
15	NT_187098	CGC	2	6	1044	1049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249776
16	NT_187098	GCC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249776
17	NT_187098	AGC	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249776
18	NT_187098	ACG	2	6	1181	1186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249776
19	NT_187098	TCGCCT	2	12	1229	1240	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409249776
20	NT_187098	CTT	2	6	1296	1301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249776
21	NT_187098	GGC	2	6	1369	1374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249776
22	NT_187098	GA	3	6	1425	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	409249776
23	NT_187098	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249776
24	NT_187098	GTT	2	6	1477	1482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249776
25	NT_187098	TCA	2	6	1676	1681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249777
26	NT_187098	TGA	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249777
27	NT_187098	GA	3	6	1821	1826	50 %	0 %	50 %	0 %	409249777
28	NT_187098	CG	3	6	1887	1892	0 %	0 %	50 %	50 %	409249777
29	NT_187098	GCG	2	6	1896	1901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249777
30	NT_187098	CATCG	2	10	1927	1936	20 %	20 %	20 %	40 %	409249777
31	NT_187098	CCA	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249777
32	NT_187098	CAC	2	6	1999	2004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249777
33	NT_187098	TCA	2	6	2009	2014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249777
34	NT_187098	GCA	2	6	2043	2048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249777
35	NT_187098	TCG	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249777
36	NT_187098	A	6	6	2086	2091	100 %	0 %	0 %	0 %	409249777
37	NT_187098	CGG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249777
38	NT_187098	A	6	6	2137	2142	100 %	0 %	0 %	0 %	409249777
39	NT_187098	T	8	8	2148	2155	0 %	100 %	0 %	0 %	409249777
40	NT_187098	TGC	2	6	2367	2372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249777
41	NT_187098	GGC	2	6	2455	2460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249777
42	NT_187098	GGC	2	6	2614	2619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249778
43	NT_187098	A	6	6	2642	2647	100 %	0 %	0 %	0 %	409249778
44	NT_187098	T	8	8	2655	2662	0 %	100 %	0 %	0 %	409249778
45	NT_187098	TG	3	6	2699	2704	0 %	50 %	50 %	0 %	409249778
46	NT_187098	GC	3	6	2943	2948	0 %	0 %	50 %	50 %	409249779
47	NT_187098	CTG	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249779
48	NT_187098	ATCC	2	8	2994	3001	25 %	25 %	0 %	50 %	409249779
49	NT_187098	TGGGG	2	10	3017	3026	0 %	20 %	80 %	0 %	409249779
50	NT_187098	CG	3	6	3027	3032	0 %	0 %	50 %	50 %	409249779
51	NT_187098	AAG	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249779
52	NT_187098	CGT	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249779
53	NT_187098	A	6	6	3094	3099	100 %	0 %	0 %	0 %	409249779
54	NT_187098	TGA	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249779
55	NT_187098	A	7	7	3202	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	409249779
56	NT_187098	CAC	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249779
57	NT_187098	GCC	2	6	3236	3241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249779
58	NT_187098	GC	3	6	3300	3305	0 %	0 %	50 %	50 %	409249779
59	NT_187098	TATCG	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	409249779
60	NT_187098	CTG	2	6	3438	3443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249779
61	NT_187098	TAA	2	6	3473	3478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249779
62	NT_187098	TGC	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249779
63	NT_187098	CCG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249779
64	NT_187098	AAAAGT	2	12	3668	3679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409249779
65	NT_187098	CGTG	2	8	3713	3720	0 %	25 %	50 %	25 %	409249779
66	NT_187098	A	6	6	3721	3726	100 %	0 %	0 %	0 %	409249779
67	NT_187098	GAA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249779
68	NT_187098	AGC	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249779
69	NT_187098	TCG	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249779
70	NT_187098	GGGC	2	8	3862	3869	0 %	0 %	75 %	25 %	409249779
71	NT_187098	CCAA	2	8	3903	3910	50 %	0 %	0 %	50 %	409249779
72	NT_187098	CTGAA	2	10	3943	3952	40 %	20 %	20 %	20 %	409249779
73	NT_187098	CTG	3	9	4149	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249779
74	NT_187098	CCG	2	6	4190	4195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249779
75	NT_187098	GAA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249779
76	NT_187098	GTGG	2	8	4220	4227	0 %	25 %	75 %	0 %	409249779
77	NT_187098	ACG	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249779
78	NT_187098	GAT	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249779
79	NT_187098	TCGT	2	8	4331	4338	0 %	50 %	25 %	25 %	409249779
80	NT_187098	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249780
81	NT_187098	CGC	2	6	4736	4741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249780
82	NT_187098	AAT	2	6	4785	4790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249780
83	NT_187098	ATT	2	6	4797	4802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249780
84	NT_187098	CCT	2	6	4804	4809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249780
85	NT_187098	CT	3	6	4821	4826	0 %	50 %	0 %	50 %	409249780
86	NT_187098	ATT	2	6	4857	4862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249780
87	NT_187098	AGGTC	2	10	4892	4901	20 %	20 %	40 %	20 %	409249780
88	NT_187098	GGC	2	6	4905	4910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249780
89	NT_187098	GCA	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249780
90	NT_187098	CT	3	6	5085	5090	0 %	50 %	0 %	50 %	409249780
91	NT_187098	GGAA	2	8	5183	5190	50 %	0 %	50 %	0 %	409249780
92	NT_187098	GCT	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249780
93	NT_187098	GCC	2	6	5223	5228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249780
94	NT_187098	ACCA	2	8	5274	5281	50 %	0 %	0 %	50 %	409249780
95	NT_187098	TGG	3	9	5284	5292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249780
96	NT_187098	TTC	2	6	5318	5323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249780
97	NT_187098	CTGCCG	2	12	5362	5373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409249780
98	NT_187098	CGGCAA	2	12	5396	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249780
99	NT_187098	CGA	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249780
100	NT_187098	GTG	2	6	5448	5453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249780
101	NT_187098	GCT	2	6	5468	5473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249780
102	NT_187098	CGG	2	6	5480	5485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249780
103	NT_187098	CCA	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249780
104	NT_187098	GC	4	8	5520	5527	0 %	0 %	50 %	50 %	409249780
105	NT_187098	CGG	2	6	5611	5616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249780
106	NT_187098	GGC	2	6	5633	5638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249780
107	NT_187098	GCG	2	6	5641	5646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249780
108	NT_187098	GCT	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249780
109	NT_187098	TGC	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249780
110	NT_187098	CAA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249780
111	NT_187098	TC	3	6	5830	5835	0 %	50 %	0 %	50 %	409249780
112	NT_187098	CGG	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249780
113	NT_187098	GC	3	6	5873	5878	0 %	0 %	50 %	50 %	409249780
114	NT_187098	ATG	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249780
115	NT_187098	TGC	2	6	5959	5964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249780
116	NT_187098	TGTCGT	2	12	5999	6010	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409249780
117	NT_187098	TCA	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249780
118	NT_187098	GAATG	2	10	6032	6041	40 %	20 %	40 %	0 %	409249780
119	NT_187098	GCC	2	6	6062	6067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249780
120	NT_187098	TAT	2	6	6076	6081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249780
121	NT_187098	CCG	2	6	6086	6091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249780
122	NT_187098	GTTA	2	8	6104	6111	25 %	50 %	25 %	0 %	409249780
123	NT_187098	GAC	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249780
124	NT_187098	GGC	2	6	6183	6188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249780
125	NT_187098	CAT	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249780
126	NT_187098	CTG	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249780
127	NT_187098	CGA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249780
128	NT_187098	CG	3	6	6313	6318	0 %	0 %	50 %	50 %	409249780
129	NT_187098	GTT	2	6	6335	6340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249780
130	NT_187098	GC	3	6	6343	6348	0 %	0 %	50 %	50 %	409249780
131	NT_187098	ACC	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249781
132	NT_187098	TGG	2	6	6545	6550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249781
133	NT_187098	GCGTTC	2	12	6557	6568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249781
134	NT_187098	TACG	2	8	6581	6588	25 %	25 %	25 %	25 %	409249781
135	NT_187098	GATG	2	8	6597	6604	25 %	25 %	50 %	0 %	409249781
136	NT_187098	GCA	2	6	6669	6674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249781
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138	NT_187098	GACT	2	8	6722	6729	25 %	25 %	25 %	25 %	409249781
139	NT_187098	CTG	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249781
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143	NT_187098	GGC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249781
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145	NT_187098	CGG	2	6	6921	6926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249781
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147	NT_187098	CGG	2	6	6981	6986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249781
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149	NT_187098	GCCG	2	8	6999	7006	0 %	0 %	50 %	50 %	409249781
150	NT_187098	GC	3	6	7048	7053	0 %	0 %	50 %	50 %	409249781
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156	NT_187098	CTG	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249782
157	NT_187098	GACC	2	8	7692	7699	25 %	0 %	25 %	50 %	409249782
158	NT_187098	GC	3	6	7701	7706	0 %	0 %	50 %	50 %	409249782
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231	NT_187098	AACG	2	8	11792	11799	50 %	0 %	25 %	25 %	409249787
232	NT_187098	TTG	2	6	11838	11843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249787
233	NT_187098	TAT	2	6	11927	11932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249787
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238	NT_187098	GGT	2	6	12122	12127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249787
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240	NT_187098	TTA	2	6	12349	12354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249788
241	NT_187098	TTC	2	6	12471	12476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249788
242	NT_187098	GGT	2	6	12489	12494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249788
243	NT_187098	ATA	2	6	12499	12504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249788
244	NT_187098	GGC	2	6	12516	12521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249788
245	NT_187098	TGA	2	6	12550	12555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249788
246	NT_187098	CGG	2	6	12564	12569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249788
247	NT_187098	CACT	2	8	12724	12731	25 %	25 %	0 %	50 %	409249788
248	NT_187098	TAA	2	6	12736	12741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249788
249	NT_187098	ATCGCC	2	12	12802	12813	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409249788
250	NT_187098	GCG	2	6	12815	12820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249788
251	NT_187098	GC	3	6	13084	13089	0 %	0 %	50 %	50 %	409249789
252	NT_187098	ATC	2	6	13226	13231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249789
253	NT_187098	GCT	2	6	13240	13245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249789
254	NT_187098	CCA	2	6	13249	13254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249789
255	NT_187098	GCG	2	6	13312	13317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249789
256	NT_187098	TGG	2	6	13401	13406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249789
257	NT_187098	TGAG	2	8	13419	13426	25 %	25 %	50 %	0 %	409249789
258	NT_187098	GGCGG	2	10	13449	13458	0 %	0 %	80 %	20 %	409249789
259	NT_187098	TCG	2	6	13476	13481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249789
260	NT_187098	CAG	2	6	13511	13516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249789
261	NT_187098	AT	3	6	13545	13550	50 %	50 %	0 %	0 %	409249789
262	NT_187098	GAT	2	6	13555	13560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249789
263	NT_187098	CCG	2	6	13573	13578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249789
264	NT_187098	GCA	3	9	13605	13613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249789
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267	NT_187098	GCT	2	6	13836	13841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249790
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294	NT_187098	GGCG	2	8	15077	15084	0 %	0 %	75 %	25 %	409249792
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500	NT_187098	T	6	6	33618	33623	0 %	100 %	0 %	0 %	409249815

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